GVasp package

Subpackages

• gvasp.common package
  • gvasp.common.base module
    • Atom
      • Atom.formula
      • Atom.number
      • Atom.period
      • Atom.group
      • Atom.color
      • Atom.order
      • Atom.frac_coord
      • Atom.cart_coord
      • Atom._default_bonds
      • Atom.atom_type()
      • Atom.search_image()
      • Atom.__load_config()
      • Atom.__initialize_attrs()
      • Atom.atom_type
      • Atom.distance()
      • Atom.search_image()
      • Atom.set_coord()
    • Atoms
      • Atoms.atom_list
      • Atoms.atom_type
      • Atoms.count
      • Atoms.elements
      • Atoms.from_list()
      • Atoms.perturb()
      • Atoms.set_coord()
      • Atoms.size
    • Lattice
      • Lattice.angle
      • Lattice.arc_lattice()
      • Lattice.from_POSCAR()
      • Lattice.from_string()
      • Lattice.inverse
      • Lattice.length
      • Lattice.strings
      • Lattice.volume
  • gvasp.common.descriptor module
    • Descriptor
    • IntegerLeftDescriptor
    • IntegerLeftRealRightDescriptor
    • TypeDescriptor
    • TypeListDescriptor
    • TypeListValueDescriptor
    • TypeValueDescriptor
    • ValueDescriptor
  • gvasp.common.error module
    • AnimationError
    • ArgsNotRegisteredError
    • AttributeNotAssignedError
    • AttributeNotRegisteredError
    • ConstrainError
    • FrequencyError
    • GridNotEqualError
    • JsonFileNotFoundError
    • ParameterError
    • PathNotExistError
    • PotDirNotExistError
    • StructureNotEqualError
    • StructureOverlapError
    • TooManyXSDFileError
    • XSDFileNotFoundError
  • gvasp.common.figure module
    • DashLine
    • Figure
      • Figure.lloc
      • Figure.save()
      • Figure.show()
    • LineBase
      • LineBase.plot()
    • PchipLine
      • PchipLine.interpolate()
    • SolidLine
    • Text
      • Text.check_overlap()
      • Text.tailor_text()
    • plot_wrapper()
  • gvasp.common.file module
    • ACFFile
    • AECCAR0
    • AECCAR2
    • ARCFile
      • ARCFile.write()
    • CHGBase
      • CHGBase.load()
      • CHGBase.write()
    • CHGCAR
      • CHGCAR.load()
      • CHGCAR.split()
    • CHGCAR_diff
      • CHGCAR_diff.line_potential()
    • CHGCAR_mag
      • CHGCAR_mag.to_grd()
    • CHGCAR_sum
      • CHGCAR_sum.from_array()
      • CHGCAR_sum.structure
    • CHGCAR_tot
    • CONTCAR
    • CellFile
      • CellFile.structure
      • CellFile.to_POSCAR()
    • DOSCAR
      • DOSCAR.ISPIN
      • DOSCAR.LORBIT
      • DOSCAR.load()
    • EIGENVAL
      • EIGENVAL.write()
    • Fort188File
      • Fort188File.constrain
      • Fort188File.write()
    • INCAR
      • INCAR.write()
    • KPATHIN
    • KPOINTS
      • KPOINTS.from_strings()
      • KPOINTS.min_number()
      • KPOINTS.write()
    • LOCPOT
      • LOCPOT.line_potential()
      • LOCPOT.load()
    • MODECAR
      • MODECAR.write_from_POSCAR()
      • MODECAR.write_from_freq()
    • MetaFile
      • MetaFile.strings
      • MetaFile.type
    • OUTCAR
      • OUTCAR.animation_freq()
      • OUTCAR.bandgap()
    • POSCAR
      • POSCAR.align()
      • POSCAR.dist()
    • POTCAR
      • POTCAR.cat()
      • POTCAR.write()
    • StructInfoFile
      • StructInfoFile.structure
    • SubmitFile
      • SubmitFile.backup_lines
      • SubmitFile.bader_lines
      • SubmitFile.build
      • SubmitFile.check_success_lines
      • SubmitFile.modify_lines
      • SubmitFile.pipe()
      • SubmitFile.spin_lines
    • XDATCAR
      • XDATCAR.movie()
      • XDATCAR.structure
    • XSDFile
      • XSDFile.strings
      • XSDFile.structure
      • XSDFile.write()
    • formatter()
  • gvasp.common.logger module
  • gvasp.common.parameter module
    • Parameter
      • Parameter.ALGO
      • Parameter.AMIX
      • Parameter.AMIX_MAG
      • Parameter.BMIX
      • Parameter.BMIX_MAG
      • Parameter.DFNMax
      • Parameter.DFNMin
      • Parameter.DRotMax
      • Parameter.DdR
      • Parameter.EB_K
      • Parameter.EDIFF
      • Parameter.EDIFFG
      • Parameter.EINT
      • Parameter.ENCUT
      • Parameter.GGA
      • Parameter.HFSCREEN
      • Parameter.IBRION
      • Parameter.ICHAIN
      • Parameter.ICHARG
      • Parameter.IDIPOL
      • Parameter.IMAGES
      • Parameter.IOPT
      • Parameter.ISIF
      • Parameter.ISMEAR
      • Parameter.ISPIN
      • Parameter.ISTART
      • Parameter.ISYM
      • Parameter.IVDW
      • Parameter.LAECHG
      • Parameter.LCHARG
      • Parameter.LCLIMB
      • Parameter.LDAU
      • Parameter.LDAUJ
      • Parameter.LDAUL
      • Parameter.LDAUPRINT
      • Parameter.LDAUTYPE
      • Parameter.LDAUU
      • Parameter.LDIPOL
      • Parameter.LHFCALC
      • Parameter.LMAXMIX
      • Parameter.LORBIT
      • Parameter.LPARD
      • Parameter.LREAL
      • Parameter.LSEPB
      • Parameter.LSEPK
      • Parameter.LSOL
      • Parameter.LVHAR
      • Parameter.LWAVE
      • Parameter.MAGMOM
      • Parameter.MAXMOVE
      • Parameter.MDALGO
      • Parameter.NBMOD
      • Parameter.NEDOS
      • Parameter.NELECT
      • Parameter.NELM
      • Parameter.NELMIN
      • Parameter.NFREE
      • Parameter.NPAR
      • Parameter.NSIM
      • Parameter.NSW
      • Parameter.POTIM
      • Parameter.PREC
      • Parameter.PRECFOCK
      • Parameter.SIGMA
      • Parameter.SMASS
      • Parameter.SPRING
      • Parameter.SYSTEM
      • Parameter.TEBEG
      • Parameter.TEEND
      • Parameter.TIME
    • bool_str()
    • int_float()
    • list_float()
    • list_int()
    • list_mag()
    • logic()
    • str_prec()
  • gvasp.common.plot module
    • DOSData
      • DOSData.get_data()
      • DOSData.center()
      • DOSData.contcar_parse()
      • DOSData.doscar_parse()
      • DOSData.get_data()
      • DOSData.parse_contcar()
      • DOSData.parse_doscar()
    • PESData
      • PESData.convert_sd()
      • PESData.convert_sc()
      • PESData.convert_sc()
      • PESData.convert_sd()
    • PlotBand
      • PlotBand.plot()
    • PlotCCD
      • PlotCCD.plot()
    • PlotEPotential
      • PlotEPotential.plot()
    • PlotNEB
      • PlotNEB.plot()
    • PlotOpt
      • PlotOpt.plot()
    • PlotPES
      • PlotPES.plot()
      • PlotPES.add_solid()
      • PlotPES.add_dash()
      • PlotPES.add_text()
      • PlotPES.add_dash()
      • PlotPES.add_pchip()
      • PlotPES.add_solid()
      • PlotPES.add_text()
      • PlotPES.plot()
    • PostDOS
      • PostDOS.center()
      • PostDOS.plot()
    • interpolated_wrapper()
  • gvasp.common.setting module
    • ConfigManager
      • ConfigManager.dict
      • ConfigManager.load()
      • ConfigManager.write()
  • gvasp.common.structure module
    • NeighbourTable
      • NeighbourTable.coordination
      • NeighbourTable.dist
      • NeighbourTable.dist3d
      • NeighbourTable.index
      • NeighbourTable.index_tuple
    • Structure
      • Structure.align()
      • Structure.check_overlap()
      • Structure.dist()
      • Structure.find_neighbour_table()
      • Structure.from_POSCAR()
      • Structure.from_cell()
      • Structure.from_structure()
      • Structure.write_POSCAR()
  • gvasp.common.task module
    • Animatable
      • Animatable.movie()
    • BandTask
    • BaseTask
      • BaseTask.PotDir
      • BaseTask.Scheduler
      • BaseTask.Template
      • BaseTask.UValueBase
      • BaseTask.generate()
      • BaseTask.get_all_parents()
    • ChargeTask
      • ChargeTask.apply_analysis()
      • ChargeTask.split()
      • ChargeTask.sum()
      • ChargeTask.to_grd()
    • ConTSTask
    • DOSTask
    • DimerTask
    • FreqTask
      • FreqTask.movie()
    • MDTask
    • NEBTask
      • NEBTask.generate()
      • NEBTask.monitor()
      • NEBTask.movie()
      • NEBTask.sort()
    • NormalTask
      • NormalTask.generate()
    • OptTask
    • OutputTask
      • OutputTask.output()
    • STMTask
    • SequentialTask
      • SequentialTask.generate()
    • WorkFuncTask
    • XDATMovie
      • XDATMovie.movie()
    • end_symbol()
    • write_wrapper()
  • gvasp.common.utils module
    • colors_generator()
    • get_HIGH_SYM()
    • get_HOME()
    • identify_atoms()
    • is_subset_recommend_pot()
    • redefine_frac()
    • remove_mapping()
    • search_peak()
    • str_list()
• gvasp.lib package

Submodules

• gvasp.main module
  • main()
  • main_args_check()
  • main_completion()
  • main_format_debug()
  • main_parser()
  • main_permission()