NEB 方法

NEB 是一种传统用来定位 TS 的方法，它通过优化反应路径上的一系列结构来定位过渡态。因此，计算成本高昂，但有时可以用来替代 Con-TS 方法搜索一些特殊的过渡态结构。

注意

不要忘记首先 对齐结构 。

GVasp 也支持生成 NEB 搜索过渡态所需的输入文件，只需要运行下述命令：

gvasp submit neb -ini/--ini_poscar INI_POSCAR -fni/--fni_poscar FNI_POSCAR [-i IMAGES] [-m METHOD] [-c/--cancel_check_overlap]

备注

The NEB method will construct the reaction path, so one use NEB method must specify the start (-ini/--ini_poscar) and end (-fni/--fni_poscar) structure, while -i, -m and -c are optional arguments.

指定 images 的个数

Images 是在初态和末态之间插入的中间体结构个数，如果不指定，默认为 4 。

指定路径生成方法

GVasp 提供两种方法来生成反应路径的结构。

一种是 linear，使用线性插值方法来生成中间体结构。

另一种是 idpp 方法，该方法声称可以生成更靠近真实反应坐标的中间体结构，更多细节可以看 这里 。

如果不指定 method，GVasp 默认采用 linear 来生成反应路径。

检查结构是否重叠

你可能注意到中间体结构是自动生成的，因此在某些体系中可能会发生原子重叠的情况，如果你不进行检查，NEB 任务很大可能会失败。

因此，GVasp 在生成 NEB 输入时总是会自动检查原子重叠。

如果你不喜欢这种默认行为，你也可以设置 -c/--cancel_check_overlap 来取消检查，但是我们（实际上是我）强烈推荐不要做这种 危险 行为。

其他的参数

备注

更多关于其他参数的信息可以参见 结构优化 任务。